Cómo una supercomputadora creó CoVPSA, la vacuna universal anti-covid-19 eficaz frente a cualquier mutación

Las mutaciones del virus COVID-19 ha provocado que la eficacia de las vacunas disminuya con el paso del tiempo.

El uso de vacunas contra el virus COVID-19 ha desembocado en una serie de múltiples variantes que han alertado a las instituciones sanitarias de todo el mundo. Hasta la fecha se conocen las variantes: Delta, ómicron, XE y Alpha.

Con tantas variantes que existen y las que estarían por desarrollarse en un futuro, uno se pregunta: ¿nos protegerán las vacunas actuales también contra esta nueva mutación?

Para solucionar esta preocupación, se ha propuesto una nueva candidata a vacuna llamada CoVPSA que trata de proteger frente a todas las variantes existentes y frente a otras que puedan aparecer en el futuro.

CoVPSA se ha obtenido gracias a un superordenador y los resultados acaban de publicarse en la prestigiosa revista Scientific Reports.

¿Cómo se ha desarrollado la vacuna?

Para diseñar esta nueva vacuna contra la covid-19 se han empleado métodos matemáticos. Las técnicas utilizadas están relacionadas con la combinatoria, la matemática discreta y las ciencias de la computación.

Ha sido fruto de la colaboración multidisciplinar entre dos instituciones científicas. En primer lugar, la Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea hizo el estudio teórico previo y la simulación computacional de la cadena de 22 aminoácidos que conforman el péptido de la vacuna.

Posteriormente, el Instituto de Investigación Sanitaria Marqués de Valdecilla (IDIVAL) y el Hospital Universitario Marqués de Valdecilla de Cantabria se encargaron de cargar dicho péptido en las células que inician una respuesta inmunitaria adaptativa en nuestro organismo (llamadas dendríticas). También se ocuparon de hacer los posteriores ensayos biológicos in vitro e in vivo. De estas pruebas de laboratorio se obtuvieron resultados positivos.

En el artículo ya mencionado se evidencia la viabilidad práctica del método, pasando de una investigación de carácter básico a una investigación traslacional. De este modo, se prepara el terreno para posibles aplicaciones clínicas a corto y medio plazo para poder obtener vacunas efectivas contra diversos tipos de enfermedades.

El superordenador Arina ha sido clave en la elaboración de una nueva vacuna universal contra el covid-19.

Vacuna universal contra todas las variantes del COVID-19

La candidata a vacuna CoVPSA fue desarrollada gracias a la potencia del superordenador Arina de los Servicios Generales de Investigación (SGIker) de la UPV/EHU. Su potencia es equivalente a la de miles de ordenadores personales agregados.

De forma ininterrumpida se utilizo la supercomputadora Arina durante varios días para programar la mencionada secuencia de 22 aminoácidos.

Este método de diseño se basa en el concepto de lambda-supercadena introducido en un estudio anterior por los equipos de estas instituciones. Se trata de un método especialmente apropiado para valorar las distintas mutaciones experimentadas por el patógeno y poder obtener una única vacuna para todas ellas.

Es decir, no se considera solamente una de las variantes, sino que se obtiene un péptido que recubre suficientemente bien los epítopos de todas las variantes que hayan ido apareciendo.

De esta forma, se obtiene una vacuna universal eficaz contra todas las mutaciones. Esta es la principal diferencia respecto a los métodos clásicos de diseño de vacunas, que no confieren protección simultáneamente contra las distintas variantes del agente patógeno.

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